Coloque ícones personalizados nos seus diretórios favoritos
AnyFolder é um programa que te permite fixar qualquer ícone a um diretório, de forma que as pastas sejam identificadas mais facilmente.

Além disso, você pode personalizar cada ícones para que ele mostre uma imagem diferente dependendo se ele está aberto ou não.

Já vem com uma coleção de 20 estilos de ícones para seus diretórios, mas você pode usar nesta função qualquer arquivo ICO que possua em seu computador.